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La principal diferencia entre la agarosa y la poliacrilamida es que la agarosa se utiliza en la electroforesis en gel de agarosa (AGE) principalmente para la separación de ADN, mientras que la poliacrilamida se utiliza en la electroforesis en gel de poliacrilamida principalmente para la separación de proteínas. Además, la agarosa puede separar fragmentos de ADN de 50-20.000 pb de tamaño, mientras que la poliacrilamida tiene un mayor poder de resolución.
Agarosa versus poliacrilamida. La agarosa y la poliacrilamida se combinan con polímeros hidroclonables, pero no se pueden utilizar con la misma facilidad. La agarosa y la poliacrilamida se encuentran en una caja de geles de poros que están disponibles en gran medida. Desondanks bestaan er een aantal duidelijke verschillen tussen de twee.
La molécula de poliacrilamida está formada por ADN o proteína. Los espacios entre los geles de poliacrilamida son más pequeños que los que hay entre los geles de agarosa, lo que constituye otra diferencia entre estas dos sustancias. Mientras que el tamaño de las bandas es el mismo en la agarosa, existen distintos tamaños de bandas en la poliacrilamida.
Al igual que los atletas que corren sobre césped en lugar de sobre arena, el gel por el que se pasa el ADN puede afectar en gran medida los resultados. Los dos tipos principales de geles que se utilizan para la electroforesis de ADN son los de agarosa y los de poliacrilamida (PA), pero determinar las diferencias puede resultar confuso. Básicamente, se elige un gel en función de dos factores principales: qué tan alta necesita la resolución y qué hay en las muestras.
En la electroforesis en gel, las moléculas se separan en función de la carga, el peso molecular y el tamaño. Por lo tanto, si cargamos muestras de ADN y ARN en el gel de agarosa para la electroforesis, se verán diferentes tipos de bandas en la tinción con EtBr.